Rejs Katharsis II dookoła Antarktydy to także unikalna szansa na badania specjalistyczne w rejonach Oceanu Południowego, które do tej pory nie były odwiedzane przez naukowców. Podczas przygotowań do Wyprawy zdecydowano, że w trakcie antarktycznego rejsu 2017/2018 załoga Katharsis II, we współpracy z Instytutem Oceanologii PAN, prowadzić będzie specjalne eksperymenty naukowe. Na pokładzie Katharsis II przedstawicielem Instytutu będzie prof. Piotr Kukliński.